牛顿的创造,标志着现代力学诞生、物理学诞生，乃至近代自然科学诞生。
然而，牛顿想要研究的问题更多。
在当今中国，牛顿往往被扭曲为“早年研究科学（成果硕硕），晚年转向神学（一无所成）”。
你是不是也以为牛顿的一生是这么个轨迹：年轻的时候惊才绝艳，在物理学上大放光芒，年纪一大反而开始不务正业，转而研究神学，最终从一个伟大的科学家沦为一个可悲的神棍？
那你就错了。
牛顿的一生从这样的角度来理解才更接近真实情况：牛到不行的牛顿决心用自己的智慧找出上帝在设计宇宙时留下的密码，从而写出了《自然哲学的数学原理》等一大堆牛逼闪闪的著作。牛顿从来就没想过要把上帝从宇宙里面摘出去，相反，他坚定不移的相信上帝的存在并且一生都在为了证明这事而努力。
这就是为什么他的墓志铭上刻着的是“Nature and nature's laws lay hid in night; God said "Let Newton be" and all was light.”（自然的法则隐藏在黑暗之中。上帝说：让牛顿出世吧，于是一切豁然开朗。）。
牛顿一生都是一个虔诚的基督徒，在牛顿的一生中，其80%以上的著作都是神学著作，总字数超过140万，也并不是晚年才转向了神学。
很多人都说牛顿晚年才开始研究神学，这是不对的，牛顿一生都在研究神学，
首先，神学不等于迷信和玄想，请先放下你对神学的偏见以及可能存在的对哲学的偏见。
其次，什么叫“客观世界的规律”？科学的任务是逼近符合绝对客观的真理吗？这种观念不要说后现代主义，就是物理学博士出身的库恩都会批判你。
然后说正事，牛顿从来没有什么晚年研究神学，对神学的研究贯穿了他的一生。他的科学观念很多都是与神学密切相关的。比如说“万有引力”这个东西。机械论的图景里面物质是惰性的，只会通过互相接触起作用。万有引力这种超距作用违背了机械论的基本观念，导致牛顿一直试图用接触作用（假想的“以太”介质）对其进行解释。这些可见于牛顿1670年代到大概1710年代的手稿，后来牛顿放弃了以太假说，转而用上帝的直接干预解释超距作用。
然后就是牛顿并不是自然神论者（认为上帝创造了物质世界后就不管它了）。在牛顿那里，上帝时刻作用于物质世界（比如上文提到的对万有引力的解释）。同时牛顿没有能量守恒的观念，在他看来，运动一直在衰减，需要由上帝进行补充。
然后再从绝对空间和惯性系的角度说一说。
爱因斯坦批判道，经典力学中惯性系的确定是一种循环论证。“它是惯性系吗？”“那要看它受不受外力”“它受不受外力呢？”牛顿曾说这要要凭借我们的聪明才智来判断，而实际上要判断物体受不受外力，只能通过观察它在惯性系里符不符合运动定律来实现。这自然是一种循环论证，但配合上牛顿的绝对空间概念，这个问题可以得到解决——绝对空间就是唯一严格的惯性系。“真正的”运动只能是相对这个空间而言的，绝对运动意味着物体在绝对空间中位置的改变。但是牛顿认为绝对空间是无限、同质的——在无限同质的虚空中并无位置可言。但这是忽略牛顿的神学观念的前提下才会出现的问题——在牛顿看来，空间是上帝的感觉中枢和认识场所，空间代表着上帝的无所不在。于是，上帝无限的意识为绝对位置和绝对运动的确定提供了保证。然而，牛顿的机械唯物论后继者们简单地取消了上帝的概念（他们并没有像康德那般对“绝对空间”和“上帝”概念进行形而上学的批判，取消上帝只是出于一种唯物论的信仰），这就使得“力”的确定和惯性系确定的困难暴露了出来。
PS.爱因斯坦的批判可能略微难以理解，因为很多人可能觉得我们可以不借助经验手段就得知“力”的存在（类似高中物理题“A物体受XXN的力”这样），并以万有引力定律为例。不过请记住，“力”的概念和三大运动定律是先于这类定律的，换言之，是我们首先接受用“力”和三大定律来解释运动的观念，再针对具体的天文现象进行研究才会得出“万有引力定律”。也就是说，只有先接受“我们可以先验地得知力的存在”这一观念，我们才可能得出万有引力定律。
最后，科学就是人建构的一种观念体系而已，不要过于神化科学，也不要先入为主地认为神学＝坏的、迷信。
你的问题其实并不成立，牛顿并没有晚年才研究神学，神学也不是迷信和偏见——中世纪的经院哲学家的理性程度和严谨程度肯定比题主高的多，科学也不是什么揭示“客观”规律的（有人要说我是科学非实在论的狂徒就说吧）。
不如读一段牛顿的原话：“如果你告诉我们说，每一种事物都有一种隐秘的特殊性质，由于它的作用而产生明显的结果，那么这实际上什么都没有说。但是先由现象得出两三条一般的运动原理，而后告诉我们，所有物体的性质和作用是如何由这些明显的原理中得出来的，那么，虽然这些原理的原因还没有发现，在哲学上却是迈出了一大步。因此，我毫无顾虑地提出了上述那些运动原理，因为它们的应用范围很广，其原因则留待以后去发现。”
这个问题至今都没有解决，也就是说说至今的人类都没彻底搞懂苹果为什么会落到地上，我们所知道的只是如何用数学描绘出一种关系，我们所谓的“明白了”只不过是将问题换了一种语言进行更清晰的表述而已。抛开牛顿不说，在很大程度上这个问题已经超出了物理学（这句话并不准确）的边界，进入了哲学与神学的领域，并且，在今天也依旧还在探寻。
问题的大标题很好，但对问题的解释存在问题，如果站在现代人对古代人的“优越感”的角度，并预设神学是完全愚昧无知且没有价值的，那么可能会得到回答而不是答案，因为这个疑惑的来源不是牛顿，而是提问中有偏差的预设和偏见。
什么叫牛顿晚年才研究神学，牛顿其实毕生都投入在神学和炼金术里。
所谓「科学」只占据了艾萨克・牛顿爵士不到一半的精力——披露运动力学的《自然哲学的数学原理》一书，书名里「自然哲学」其实是神学的分支。当时的牛顿认为「自然哲学的任务是恢复关于整个宇宙体系的知识，包括作为造物主和永恒动因的上帝」。
牛顿全身心投入在神学和炼金术里，物理学只是这一过程的 bonus。1936 年有人发掘了一箱子牛顿的文件，里面的材料绝大部分与光学或行星运动没有丁点关系，却有着把低贱金属变成贵金属的手札。20 世纪 70 年代，人们发现牛顿的发丝含有浓度是常人 40 倍的汞——这种元素在当时除了炼金术士、制帽商和温度计制造商外没有人感兴趣。
牛顿花了无数个日夜来钻研圣经年代学，为了研究古耶路撒冷的所罗门神殿平面图，还专门学了希伯来语。他认为自己能用数学方法确认基督二次降临和世界末日的日期。他相信摩西早就知道万有引力定律。
科学革命前的「关联宇宙论」——即上帝为宇宙各个角落乃至人心都植入一种隐秘关联，而科学家的宗旨是通过可见迹象来寻找并总结这些关联——深入人心，这也是为什么开普勒、玻意耳、牛顿等人始终坚持认识自然就是认识上帝。其实在第一次科学革命的时代，宗教才是研究自然的原动力，绝大多数科学家都是罗马教会直辖的耶稣会教士，各大科学院和大学拿的都是教皇的 funding。在16、17 世纪和中世纪，并无一个与教会对立的科学家阵营，压迫和对立的流行故事（比如伽利略、哥白尼等）不过是后世简化、夸张甚至捏造，为博「上帝已死」以来某些阶层的欢心。
这个过程，我没有感受到，也就是说从理性走向感性的认知，或者说从理性信仰（自然科学）走向感性信仰（神学），这是需要经历相当多的思考才可能出现的状态，之前就和朋友们讨论过关于，为什么爱因斯坦 居里夫人等等很多学术上的先驱，或者众人所理解的理性派的学者，到了晚年，到了一定阶段都会信仰宗教或者研究神学，初初讨论下来，好像确实是所谓的老眼昏花所致，这也极大的削减了他们在自然科学和理学上的探索热情。直到我在法国和几位学长在聊到这个问题的时候，才有幸体会到了整个转变的过程（不是我的转变，我还没有这个水平和资格）。这几位学长有的是学经济学，有几位学的是法学，有的是文学，还有的是学机械，电控的。他们并不是所有人最后都选择了信仰宗教，但是讨论下来的结果是，上帝的存在是必要的，和必须的。当然，我们在这里提到的上帝不是指任何具体意义上的宗教信仰，他泛指一切事物的起源，和佛 元始天尊 阿拉真主都是一样的，就是世界的起源，或者一切事物的开始。这几个学长有很多共同点，他们都在学术上小有成就，看了很多书，思考了很多东西，他们的导师和教授绝大部分也都有一个宗教信仰（代称）。学长给我的解释是，如果没有上帝，或者这个概念存在的话，那么现在我们所聊的一切事物都将失去任何的意义，因为失去了一切的基础。所以，当知识和思考深度到一定的阶段之后，就必须有一个能够解释一切开始的东西存在，否则晚上睡不着觉。如果宇宙的起源是一场爆炸的话，那么上帝就是点炮那个人。无论哲学界 自然科学界都会需要这么一个能够解释一切开始的东西存在的理由。他可以不是上帝，他可以是任何的东西，但是，无论是什么，都是一个代称，谓指一切的开始。这当然也和笛卡尔的我思故我在逻辑暗合，笛卡尔认为，我们都具有对完美实体的概念，由于我们不可能从不完美的实体上得到完美的概念，因此必定有一个完美实体——即上帝——的存在来让我们得到这个概念。这也是笛卡尔和众多学者当中所公认的一个怀疑的法则，怀疑是必定有极限的，必须要有个不能被怀疑的事件或者理论，来支撑整个逻辑推演体系的构建，否则，怀疑将不可能有尽头，一切也都将失去探索的意义。
牛顿迷恋和钻研宗教与神秘思想，写下了大量的《圣经》评注和其他神学论文，认为“上帝统治万物，我们是他的仆人而敬畏他、崇拜他。
匿名用户
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有一个程序猿写了一套叫Life1.0 bate的程序，运用了用最精确的赋值和最精巧的算法让这套程序执行。
但是程序始终无法执行，因为这个程序太过复杂，需要一套高级的操作系统。于是他又费尽心思写了一个Universe1.0 bate。写它多么费尽心思呢？比如几个定量值：一个后来被该程序自动命名为「强相互作用力」的定量，如果稍微改变0.5%，碳和氧这两段代码就无法执行，Life也会崩溃；同样是以后被这套程序自动命名为「质子质量」的定量，如果稍微增加2%，质子这段代码也会无法执行，整个Universe都会崩溃。
好了，系统也写好了，但是硬件跟不上——在穷逼程序猿的小霸王测试机里，这套系统根本打不开，相当于只有一个奇点。怎么办？程序猿又费尽更大的心思终于倒腾出了一个量子计算机——用上量子计算机，这一套系统不仅能够完美运行，而且运行时每一个时刻都可以给出一个变量在可变范围内的无数个赋值....嗯，后来那套程序又给这个逆天的电脑性能起了一个名字，好像叫「不确定性原则」，然后又衍生出了「平行宇宙」这种让民科们为之癫狂的概念...
那么最初那台小霸王机呢？——爆炸了。
后来呢？
University1.0 bate经过在量子计算机上的不断调试下，最终成为了Universe Max.
Life在经过不断的调试与升级之后，现在已经成为了Life 5.0.
但是这个Life 5.0在这么强大的硬盘上面所占的空间简直沧海一粟，这个程序猿闲得蛋疼，又倒腾出了更多的Life II、Life III、Life IV、Life V......
其中的一个程序上，有一种被命名为「科学家」的东西发现了他们所处硬盘上的算法，甚至计算出了一些定值的精确量。他们还运用倒推法，意识到了他们的神话中那个牛逼程序猿的存在。于是他们便努力去证明那个程序猿的存在。
不过这个程序上有一种东西，他们的格局很低，仅仅是作为一段代码，随着大数据的波涛逐流。他们看不起那种叫作「科学家」的东西，如同井底蛙嘲笑天上雁不知往哪去飞的苦衷。
嗯，作为这个程序里的一员，我也不敢明确揣测这个牛逼的程序猿是否存在。或许这一切牛逼的算法，都不过是自然世界通过层层筛选与递加产生的。
哦对了，听说再过一段时间这个程序猿就要放弃对Universe Max系统的更新服务了，好像是主机性能将逐步降低，把持不住这个系统了。
终于找到同样有这种想法的人了！不仅生物、整个自然界如此复杂而又准确的运作，如果不用编程来解释，那我们只能感叹自然的鬼斧神工。总之，我认为科学的终点或者巅峰可能是所谓的神学，这个“神”，并不是我们平时所说的鬼神，而是一个造物主。
可以这么设想，如果游戏里面的某个人物突然有了自己独立的意识，并且意识到了自己仅仅是相对于人类世界来说存在于虚拟世界的娱乐产物，自己的样貌、技能实际都是人类世界的一串代码，他想从虚拟世界中研究人类的世界，但是游戏中其他人物认为自己是个疯子。牛顿便是这个人，其余人类是游戏中其他人物。
设想结束，我想表达的是，我们人类可能是高于我们层次的其他物种（我们所说的造物者）用代码编写出的一种低于或独立于他们世界的虚拟（甚至娱乐？）的东西。因为地球上所有生物的构成是如此复杂而准确。当然，这也只是一个设想，地球的起源、生物的形成都是一个未知之谜，还需要很多个像牛顿一样的大神来揭开（当然，一个牛顿顶一万个无知的人类
牛顿是穷其一生利用科学在证明上帝的万能和奇妙。
相信上帝的存在并以探究和发现上帝的秘密为己任，本质上这就脱离了科学与神学自身的范畴。像牛顿这种科学界和神学界的大佬将两个完全相的领域完美的结合在了一起。简单的逻辑就是：我信上帝-我发现了自然规律-卧槽，上帝居然这么吊，将自然设计的如此精妙。
作者：终极皮怪
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来源：知乎
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因为牛顿明白，如果没有初始的第一推动力，那么这个世界就不会运转，如果没有运动过程的外力约束，运动更加不可能呈现和谐美妙的变化。
其实牛顿并非后半生才投入神学的怀抱，他终其一生都是一个虔诚的基督徒。 以下是老牛的语录：“如果我们用尽一生也无法揣测上帝的意图，那就尽全力理解他所创造的世界吧。”
是你老眼昏花，是你思维受限，当你发现了这个世界的规律用公式表达的这么完美，你能相信这一切是纯自然的吗？神或者上帝肯定是有的，它代表着已存在的强大而有力的未知事物，我们现在对很多东西还是一知半解的，比如量子纠缠，暗物质和暗能量，弦理论，引力波等等等等